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一般软件 蛋白质相关 核苷酸相关 分子进化 蛋白质残基网络 抗病毒药物设计 计算机辅助疫苗设计 药物和抗体数据库    

 

 

 

     

 

 

 

 


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RANKPEP
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T细胞免疫应答是由抗原表位驱动的,因此其识别对于了解疾病的发病机制和病因以及疫苗设计非常重要。有两种类型的T细胞抗原决定簇,分别称为CD8和CD4,它们仅在MHCI和MHCII分子的上下文中被相应的T细胞类型识别。参与两组T细胞对于增强针对癌细胞和病原体的防御性免疫反应是理想的。因此,我们已经开发了该位点,用于预测肽与MHCI和MHCII分子的结合,以及随后对CD8-和CD4-T细胞表位的预期。抗原肽与相关MHC分子结合之前必须进行适当的加工。顺便提一句,大多数MHCI限制的抗原决定簇(CD8-T细胞抗原决定簇)的C端是由蛋白酶体切割产生的,因此,蛋白酶体特异性对于确定T细胞抗原决定簇很重要。因此,该位点还可以确定预测的MHCI配体的C端是否是蛋白酶体切割的结果。 RANKPEP Web服务器中还实现了可变性屏蔽功能,以专注于保守表位的预测,因此可以帮助避免因突变而导致的免疫逃逸。

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Immune Epitope Database
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免疫表位数据库(IEDB)是NIAID提供的免费资源。 它列出了在传染病,变态反应,自身免疫和移植的背景下在人类,非人类灵长类动物和其他动物物种中研究的抗体和T细胞表位的实验数据。

 

 

 

 

 

抗病毒药物设计

致病病毒是人类健康的巨大威胁,自有记录的人类文明开始,死于病毒感染的人数以亿计。天花一度是文明社会的噩梦;1918年的西班牙大流感,导致近三千万人死亡;2014年非洲爆发的“埃博拉疫情”让世人闻之色变,而艾滋病毒、肝炎病毒等慢性致病病毒,不仅极大地威胁着人们的身体健康,也带来了诸多的社会问题。随着医药科技的发展,恶性致病病毒的致死率和流行面积大大下降,但致病病毒感染仍是人类健康的重大威胁,因此,对于抗病毒药物的研究开发,是极其迫切和重要的!

 

上海市浦东新区沪城环路999号