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一般软件 蛋白质相关 核苷酸相关 分子进化 蛋白质残基网络 抗病毒药物设计 计算机辅助疫苗设计 药物和抗体数据库    

 

同源建模专题

 

分子对接

 

分子动力学模拟


Crystal structure of 2019-nCoV spike receptor-binding domain bound with ACE2 (ID:6M0J )

 

Spike protein PDB structures

 

生物分子模拟论坛

 

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PyMOL
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PyMOL || 免费开源版(非Edu版)PyMOL安装教程

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以下是PyMOL学习视频:

pymol实用视频

周陈芬,PyMOL的基本操作

用PyMOL做一个视频

使用PyMOL查看SARS冠状病毒非结构蛋白模型

Molecular Modeling with PyMOL (英文)

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PROVEAN
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PROVEAN || PROVEAN Web Server

PROVEAN(蛋白质变异效应分析仪)是一种软件工具,可预测氨基酸取代或插入缺失对蛋白质的生物学功能是否有影响。

 

 

受体和配体


HHPred9 server

Models:

I-TASSER

evaluation:

RAMPAGE

TM-score on-line

transmembrane helical segments testing:
TMHMM Server v. 2.0

MEMSAT

MEMPACK

 

 

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Open Babel
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Open Babel

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WinCoot
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WinCoot install and download

 

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rDock

 

 

 

我们的研究重点

我们以S蛋白为研究重点,以冠状病毒中和抗体筛选为主要探索方向。

上海市浦东新区沪城环路999号