计算机辅助药物设计导论

付伟,叶德泳(第二版, 2017)
序言|| 前言 2 || 第一版前言 2
目录 p1 || p2 || p3 || p4 || p5
第1章 药物设计的基本概念和理论基础 第5章 计算机辅助药物设计方法学
第2章 新药发现的化学信息和生物信息 第6章 先导化合物优化
第3章 有关理论、技术和设备 第7章 计算机辅助药物设计应用实例
第4章 计算机辅助药物设计的意义
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第2章 新药发现的化学信息学和生物信息学


2.1 药物研究种的信息处理 p54, 55 2.5.1 序列分析与比对 p74
2.1.1 化学信息学子啊药物研究中的作用及应用 p5556 2.5.2 蛋白质结构预测 p75
2.1.2 生物信息学子啊药物研究中的作用及应用 p5657 2.5.3 蛋白质功能预测 p7576
2.1.3 数据挖掘在药物研发中的应用 p5758 2.6 与新药研发相关的数据库 p76
2.1.3.1数据挖掘在药物蛋白质组学与药物发现中的应用 p58 2.6.1 化合物数据库 p76
2.1.3.2 数据挖掘在中医药现代化中的应用 p59, 60 2.6.1.1 结构数据库 p7677
2.1.3.3 数据挖掘在在药物设计中的应用 p60 2.6.1.2 泽合化学数据库 p7778
2.1.3.4 应用数据挖掘构建反应知识库 p60 2.6.1.3 商品化学物数据库 p7879
2.2 化学小分子的处理 p60 2.6.1.4 类药物化合物库 p7980
2.2.1 化学结构的编码 p60 , 61 2.6.1.5 天然产物数据库 p8081
2.2.2 分子结构的计算机表示 p62 2.6.2 化学信息数据库 p81
2.2.2.1 分子结构的层次 p62 2.6.2.1 化学信息综合平台 p81
2.2.2.2 线性码 p62, 63 2.6.2.2 合成反应信息数据库 p82
2.2.2.3 文本串 p63 2.6.3 药物信息综合平台 p8384
2.2.2.4 分子结构的3D表示 p63, 64, 65 2.6.4 药物靶点数据库 p8485
2.2.3 化学结构信息的存储 p65 2.6.5 中药数据库 p85
2.2.3.1 分子结构的文件格式 p65, 66, 67 2.6.6 药效团数据库 p86
2.2.3.2 分子存储格式及其相互转换 p67 2.6.7 分子生物学数据库 p86
2.2.4 分子性质的表示 p67, 68, 69 2.6.7.1 基因组数据库 p86
2.2.5 计算机分子模型技术及结构显示 p69 2.6.7.2 蛋白质一级数据库 p8687
2.2.5.1 结构模型 p69 2.6.7.3 蛋白质结构数据库 p87
2.2.5.2 生物大分子模型 p70 2.7 信息计算新技术 p8788
2.2.5.3 分子表面模型 p70 2.7.1 集群计算 p88
2.3 分子相似性搜索 p70 2.7.2 网格计算 p8889
2.3.1 基本概念 p7071 2.7.3 云计算 p8990
2.3.2 相似度计算公式 p71 2.7.4 信息计算新技术在医药行业中应用 p9091
2.3.3 分子相似性搜索的应用 p7273 参考文献 p91
2.4 合成反应信息处理和计算机辅助有机合成 p73 进一步参考文献 p92
2.5 生物大分子的信息处理 p74