| 5.1 直接药物设计 page143 |
5.2.3 3D-QSAR法 p169 |
| 5.1.1 活性位点分析 page 144 |
5.2.3.1 3D-QSAR的方法 p169， 170, 171, 172, 173, 174, 175 |
| 5.1.2 基于靶点结构的三维结构搜寻 page 145 |
5.2.3.2 3D-QSAR的评价 p175 |
| 5.1.2.1 基于分子对接的三位结构搜寻 p146，147, 148, 149, 150, 151 |
5.2.3.3 CoMFA和CoMSIA分析案例----对甲磺胺基苯乙胺类抗心律失常化合物的研究 p175， 176，177 |
| 5.1.2.2 基于受体药效团模型的虚拟筛选 p152， 153 |
5.3 计算机辅助药物设计新策略和新方法 p177 |
5.1.3 全新药物设计 page 154 |
5.3.1 基于序列的药物设计 p177 |
5.1.3.1 分子片段法 p155
|
5.3.2 基于片段的药物设计 p178 |
5.1.3.2 SAR by NMR法 p156， 157
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5.3.2.1 FBDD基本原理 p179 |
5.1.3.3 动力学算法 p158
|
5.3.2.2 FBDD技术 p179， 180， 181, 182 |
| 5.1.3.4 基于结构设计的骨架和取代基团重组法 p158 |
5.3.2.3 活性片段的优化和组装 p182， 183， 184, 185 |
5.1.3.5 蒙特卡洛全新配体生成法 p159
|
5.3.2.4 计算机辅助基于片段的药物设计 p185 |
5.1.4 蛋白质结构预测 page159
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5.3.2.5 案例分析 ---乳酸脱氢酶抑制剂的设计和优化 p186 |
5.1.4.1 序列分析与比对 page160
|
5.3.3 多靶点药物设计 p186， 187, 188， 189， 190 |
| 5.1.4.2 同源蛋白建模 page 161，162，163 |
5.3.4 网络药理学 p190， 191 |
| 5.2 间接药物设计 p163 |
5.3.5 反向对接 p191， 192， 193 |
| 5.2.1 基于药效团模型的药物设计和虚拟筛选 p163 |
5.3.6 组合化学与合理药物设计的结合策略 p193 |
| 5.2.1.1 基于配体的药效团模型 p163，164， 165 |
5.3.6.1 组合化学库的设计 p193， 194 |
| 5.2.1.2 基于配体的药效团模型构建步骤 p165 |
5.3.6.2 虚拟组合化学库用于基于结构的药物设计 p194， 195， 196 |
| 5.2.1.3 基于配体的药效团模型的虚拟筛选 p166 |
参考文献 p196 |
| 5.2.1.4 基于配体的药效团模型的药物发现案例 p167 |
进一步参考文献 p197， 198 |
5.2.2 基于配体相似性的虚拟筛选 p167， 168， 169
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