第3章 有关理论、技术和设备
| 3.1 常用的计算类型 p96 |
3.2.2 .2 能量函数的约束和限制 p113 |
| 3.1.1 势能面 p96, 97 |
3.2.2.3 能量优化方法 p113 |
| 3.1.2 单点能 p97 |
3.2.3 量子力学与分子力学相结合的方法（QM/MM) p113 |
| 3.1.3 几何优化 p97, 98 |
3.2.4 分子动力学模拟方法 p115, 116, 117, 118 |
| 3.1.4 分子性质计算 p98, 99 |
3.2.5 自由能计算 p118, 119 |
| 3.1.4.1 热力学和结构性质 p99, 100 |
3.3 数据统计分析方法 p119, 120 |
| 3.1.4.2 电离势 p100 |
3.3.1 模式识别法 p120, 121, 122 |
| 3.1.4.3偶极矩 p100 |
3.3.2 人工神经网络法 p122, 123 |
| 3.1.4.4 静电势 p100, 101 |
3.4 药物和十五大分子测定的实验方法和技术 p123 |
| 3.1.4.5 电子密度与分子轨道 p101 |
3.4.1 蛋白质三维结构的测定方法 p123 |
| 3.1.4.6 布居分析 p101 |
3.4.1.1X射线晶体学 p123, 124, 125 |
| 3.1.5 构象分析 p101 |
3.4.1.2 核磁共振技术 p125 |
| 3.1.5.1 系统搜索法 p102 |
3.4.1.3 其他生物物理学测定技术 p125, 126 |
| 3.1.5.2 距离几何法 p102 |
3.4.2 药物-蛋白质结合位点的测定方法 p126 |
| 3.1.5.3 随机搜索法 p102 |
3.4.2.1 X晶体衍射和核磁共振技术 p126 |
| 3.1.5.4 蒙特卡洛法 p102, 103 |
3.4.2.2 定点突变技术 p126 |
| 3.1.5.5 模拟退火搜索法 p103 |
3.4.2.3 化学小分子探针技术 p127 |
| 3.1.5.6 遗传算法 p103, 104 |
3.4.3 药物-蛋白质结合和结合常数的测定方法 p127 |
| 3.1.5.7 分子动力学法 p104 |
3.4.3.1表面等离子共振技术p127, 128 |
| 3.2 理论计算基础 p104 |
3.4.3.2 光谱法 p128 |
| 3.2.1 量子化学 p105 |
3.4.3.3 色谱法 p128 |
| 3.2.1.1 量子化学基本理论 p105, 106, 107 |
3.4.3.4 FRET法 p128， 129 |
| 3.2.1.2 量子化学计算方法 p107, 108, 109 |
3.4.3.5其他常规方法 p129， 130 |
| 3.2.1.3 量子化学在药物设计中的作用 p109, 110 |
参考文献 p130 |
| 3.2.2 分子力学 p110 |
进一步参考文献 p130 |
| 3.2.2 .1 分子力场及能量表达形式 p110, 111, 112 |
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