彭司实验室

我们做生物信息学和计算机辅助药物设计研究，用计算的方法来研究生物学，以及计算机辅助药物设计。我们诚挚地邀请本校各专业同学与我们合作开展科学研究，特别欢迎大三，大四的本科生与我们合作。专业不限，有无编程能力不限。但需要有一定的生物学基础知识。

我们尤其欢迎生物科学，生物技术，海洋生物，水产养殖，动物医学等专业的同学们加入我们的研究团队。

不论你是大四做本科毕业论文，还是在大一，大二就想做科研，发论文，我们都欢迎你加入我们的研究团队。

我们也欢迎硕士生，博士生与我们开展合作研究。

我们目前的研究方向：

一、冠状病毒的分子进化
1. 蝙蝠冠状病毒跨物种传染的机制研究；  
2. 冠状病毒基因组的分子进化及重组特征研究 ；   
3. SARS-cov-2病毒基因组系统发育动力学。

二、 新冠病毒的计算机辅助药物设计
1. SARS-cov-2主蛋白酶（3-CL-p，nsp5） 抑制剂的虚拟筛选 ；
2.基于分子对接和分子动力学模拟技术的SARS-cov-2变异特征研究；
3. SARS-cov-2主蛋白酶（n3-CL-p，sp5）与FDA批准药物的分子对接及动力学模拟；
4.基于 SARS-cov-2解旋酶（nsp13） 晶体结构的抑制剂虚拟筛选；
5.SARS-cov-2非结构蛋白（nsp10 ）的同源建模及抑制剂的虚拟筛选；
6.SARS-cov-2 ORF1ab编码的非结构蛋白（NSP1-NSP16）活性位点评估；
7.基于SARS-cov-2非结构蛋白（RdRp， nsp12） 晶体结构的抑制剂虚拟筛选；
8.SARS-cov-2非结构蛋白（nsp14）药效团模型构建及药物虚拟筛选；
9. 基于分子对接技术和分子动力学模拟的SARS-cov-2 S蛋白与人类受体ACE2的相互作用研究；
10. 基于深度学习的SARS-cov-2非结构蛋白（nsp16）靶点的药物设计。

三、G蛋白偶联受体药物靶点发现
1. beclomethasone dipropionate小分子与粘附G蛋白偶联受体的分子对接与分子动力学模拟；
2. ezetimibe小分子与粘附G蛋白偶联受体的分子对接与分子动力学模拟；
3. flunarizine小分子与粘附G蛋白偶联受体的分子对接与分子动力学模拟；
4. zeranol小分子与粘附G蛋白偶联受体的分子对接与分子动力学模拟；
5. 3-α-acetoxydihydrodeoxygedunin 小分子与粘附G蛋白偶联受体的分子对接与分子动力学模拟；
6. dihydromunduletone小分子与粘附G蛋白偶联受体的分子对接与分子动力学模拟；
7. synaptamide 小分子与粘附G蛋白偶联受体的分子对接与分子动力学模拟；
8. anandamide小分子与粘附G蛋白偶联受体的分子对接与分子动力学模拟。
9. 基于分子动力学模拟的 A型 G蛋白偶联受先导化合物发现；
10. 基于深度学习的粘附G蛋白偶联受体药物靶点发现。

四、抗衰老药物靶标识别与预测

1. 抗衰老药物senolytics的靶标预测研究
2. 基于反向分子对接的抗衰老药物α-酮戊二酸 (2-Ketoglutaric acid)靶标预测研究

五、癌症靶标筛选

1. 4-羟基苯乙酮（4-Hydroxyacetophenone）与非肌肉肌球蛋白的分子对接研究

合作研究沟通方式：线下组会讨论，线上会议(腾讯会议）
合作计算资源：可远程登录我们的Linux服务器

联系人：彭司华
shpeng@shou.edu.cn
微信：Thales2019