AMBER
AMBER分子动力学程序包是由加州大学旧金山分校(University of California San Francisco,UCSF)的Peter A Kollman和其同事编写的,大约包含60多个程序,相互协调工作。
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Amber20 | DS | AutoDock Vina | CHARMM | GROMACS | GROMOS | PyMol |
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AMBER高级教程A1:模拟含有非标准残基的溶剂化蛋白(简单版本) AMBER高级教程A2:耦合势的QM/MM(量子力学/分子动力学)模拟 AMBER高级教程A8:HIV-1整合酶核心结构域的环区动力学 AMBER高级教程A16:Amber脂分子教程:Lipid14力场版本 AMBER高级教程A24 使用FEW(Free Energy Workflow)工具计算自由能
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