| ================ SARS-cov-2基因组 ================ |
======== 基因组汇总 ======== |
======= 数据汇总 ======= |
GISAID data download (01-April-2020) SARS-cov-2-3327-genome-aligned (2732 cases in GISAID,up to 01-April-2020, 505 cases NCBI, 11-April-2020) excel 1. SARS-cov-2： MN908947(Dec-2019）复旦 2. MN996529 武汉 （23-Dec-2019） 3. MT019529 武汉 （23-Dec-2019） 4. MT019530 武汉 （30-Dec-2019） 5. MT019531 武汉 （30-Dec-2019） 6. MT019532 武汉 （30-Dec-2019） 7. MT019533 武汉 （30-Dec-2019） 8. MN996527 武汉 （30-Dec-2019） 9. MN996528 武汉 WIV04 （30-Dec-2019） 石正丽 10. MN996530 武汉 （30-Dec-2019） 11. MN996531 武汉 （30-Dec-2019） ================================== 12. LC529905 日本 Jan-2020 13. MT039890 韩国 （Jan-2020） 14. MN988668 中国 （02-Jan-2020） 15. MN988669 中国 （02-Jan-2020） 16. MT093631 中国 （08-Jan-2020） 17. MN938384 深圳 （10-Jan-2020） 18. MN975262 中国 （11-Jan-2020） 19. MT072688 尼泊尔 （13-Jan-2020） 20. MT049951 云南 （17-Jan-2020） 21. MN985325 美国 （19-Jan-2020） 22. MT226610 中国 （20-Jan-2020） 23. MT039873 杭州 （20-Jan-2020） 24. MN988713 美国 IL （21-Jan-2020） 25. MN997409 美国 （22-Jan-2020） 26. MT192772 Viet Nam: Ho Chi Minh city （2020-01-22） 27. MT192773 Viet Nam: Ho Chi Minh city （2020-01-22） 28. MN994467 美国 （23-Jan-2020） 29. MN994468 美国 CA （23-Jan-2020） 30. MT020881 美国 WA （25-Jan-2020） 31. MT007544 澳大利亚 （25-Jan-2020） 32.MT192759 台湾 （25-Jan-2020） 33. MT135041 北京 （26-Jan-2020） 34. MT044258 美国 CA （27-Jan-2020） 35. MT123292 广州 （27-Jan-2020） 36. MT012098 印度 （27-Jan-2020） 37. MT135042 北京 （28-Jan-2020） 38. MT135043 北京 （28-Jan-2020） 39. MT135044 北京 （28-Jan-2020） 40. MT044257 美国 IL （28-Jan-2020） 41. MT020781 芬兰 （29-Jan-2020） partial 42. MT020880 美国 WA （29-Jan-2020） 43. MT027062 美国 CA （29-Jan-2020） 44. MT027063 美国 CA （29-Jan-2020） 45. MT027064 美国 CA （29-Jan-2020） 46·. MT123293 广州 （29-Jan-2020） 47. MT123291 广州 （29-Jan-2020） 48. LR757995 武汉 (30-JAN-2020 sub) 49. LR757996 武汉 (30-JAN-2020 sub) 50.LR757997 武汉 （30-Jan-2020）Partial 51. LR757998 武汉 (30-JAN-2020 sub) 52. MT066156意大利 （30-Jan-2020） 53. MT039887 美国 WI （31-Jan-2020） 54. MT039888 美国（31-Jan-2020） 55. MT066175 台湾 （31-Jan-2020） 56. MT066176 台湾 （31-Jan-2020） 57. MT050493 印度 （31-Jan-2020） ================================== 58. MT106052 美国CA （06-Feb-2020） 59. MT093571 瑞典（07-Feb-2020） 60. LC528232 (日本，2020-02-10） 61. LC528233 (日本，2020-02-10） 62. MT106053 美国CA （10-Feb-2020） 63 MT106054 美国TX （11-Feb-2020） 64. MT118835 美国 （23-Feb-2020） 65. MT152824 美国 （24-Feb-2020） 66. MT126808 （巴西，28-Feb-2020） 67. MT159705 美国 （17-Feb-2020） 68. MT159706 美国（17-Feb-2020） 69. MT159707 美国（17-Feb-2020） 70. MT159708 美国（17-Feb-2020） 71. MT159709 美国（20-Feb-2020） 72. MT159710 美国（17-Feb-2020） 73. MT159711 美国（20-Feb-2020） 74. MT159712 美国（25-Feb-2020） 75. MT159713 美国（18-Feb-2020） 76. MT159714 美国（18-Feb-2020） 77.MT159715 美国（24-Feb-2020） 78.MT159716美国（24-Feb-2020） 出现大片段缺失 79.MT159717美国（17-Feb-2020） 80.MT159718美国（18-Feb-2020） 81.MT159719美国（18-Feb-2020） 82.MT159720美国（21-Feb-2020） 83.MT159721美国（21-Feb-2020） 84.MT159722美国（21-Feb-2020） 85.MT163716 美国（27-Feb-2020) 86.MT163717 美国（28-Feb-2020) 87.MT163718 美国（29-Feb-2020) 88. MT184907 美国 18-Feb-2020 89.MT184908 美国 21-Feb-2020 90.MT184909 美国 21-Feb-2020 91.MT184910 美国 18-Feb-2020 92.MT184911 美国 17-Feb-2020 93.MT184912 美国 17-Feb-2020 94.MT184913 美国 24-Feb-2020 95.MT163719 美国（01-Mar-2020) 96.MT163720 美国（01-Mar-2020) near complete 97.MT163721美国（01-Mar-2020) near complete 98.MT198651 Spain: Valencia （04-Feb-2020）near complete 99.MT198652 Spain: Valencia （05-Feb-2020）near complete |
100. MT123290 中国广州 （05-Feb-2020） 101. MT198653 Spain: Valencia （08-Feb-2020）near complete LC534418 Japan 2020-02-14 102..MT188339 美国（09-Mar-2020） 103. MT188340 美国（07-Mar-2020） 104. MT188341 美国（05-Mar-2020） 105. MT192765 美国: CA （2020-03-11） 106. MT233519 Spain: Valencia 2020-02-27 107. MT233520 Spain: Valencia 2020-02-26, gapped 108. MT233521 Spain: Valencia2020-02-27, gapped 109. MT233522 Spain: Valencia2020-03-02 110. MT233523 Spain: Valencia 2020-03-04 111.MT240479 Pakistan: Gilgit 2020-03-04 LC534419 Japan 2020-03-09 112.MT246449 USA: WA 2020-03-13 113. MT246450 USA: WA 2020-03-13 114.MT246451 USA: WA 2020-03-13 115. MT246452 USA: WA 2020-03-13 116. MT246453 USA: WA 2020-03-13 117.MT246454 USA: WA 2020-03-12 118.MT246455 USA: WA 2020-03-12 119. MT246456 USA: WA 2020-03-13 120 MT246457 USA: WA 2020-03-12 121. MT246458 USA: WA 2020-03-12 122.MT246459 USA: WA 2020-03-12 123.MT246460 USA: WA 2020-03-12 124. MT246461 USA: WA 2020-03-13 125.MT246462 USA: WA 2020-03-13 126.MT246463 USA: WA2020-03-13, gapped 127.MT246464 USA: WA2020-03-13 128. MT246465 USA: WA 2020-03-13, gapped 129.MT246466 USA: WA 2020-03-13 130.MT246467 USA: WA 2020-03-14 131.MT246468 USA: WA 2020-03-14 132 MT246469 USA: WA 2020-03-14 133 MT246470USA: WA 2020-03-13 134 MT246471 USA: WA 2020-03-14 135 MT246472 USA: WA 2020-03-12 136 MT246473 USA: WA 2020-03-14 137 MT246474 USA: WA 2020-03-14 138 MT246475 USA: WA 2020-03-13 139 MT246476 USA: WA 2020-03-13 140 MT246477 USA: WA 2020-03-14 141 MT246478 USA: WA 2020-03-14 142 MT246479 USA: WA 2020-03-13 143 MT246480 USA: WA 2020-03-13 144 MT246481 USA: WA 2020-03-13 145 MT246482 USA: WA 2020-03-15 146 MT246483 USA: WA 2020-03-15, gapped 147 MT246484 USA: WA 2020-03-15 148 MT246485 USA: WA 2020-03-15 149 MT246486 USA: WA 2020-03-14 150 MT246487USA: WA 2020-03-15 151 MT246488 USA: WA 2020-03-14 152 MT246489 USA: WA 2020-03-14 153 MT246490 USA: WA 2020-03-15 MT251972 USA: WA 2020-03-14 MT251973 USA: WA 2020-03-14 MT251974 USA: WA 2020-03-12 MT251975 USA: WA 2020-03-14 MT251976 USA: WA 2020-03-14 MT251977 USA: WA 2020-03-14 MT251978 USA: WA 2020-03-14 MT251979 USA: WA 2020-03-14 MT251980 USA: WA 2020-03-13 MT253696 China: Hangzhou 2020-01-23 MT253697 China: Hangzhou 2020-01-23 MT253698 China: Hangzhou 2020-01-23 MT253699 China: Hangzhou 2020-01-24 MT253700 China: Hangzhou 2020-01-25 MT253701 China: Hangzhou 2020-01-21 MT253702 China: Hangzhou 2020-01-21 MT253703 China: Hangzhou 2020-01-25 MT253704 China: Hangzhou 2020-01-25 MT253705 China: Hangzhou 2020-01-22 MT253706 China: Hangzhou 2020-01-22 MT253707 China: Hangzhou 2020-01-25 MT253708 China: Hangzhou 2020-01-21 MT253709 China: Hangzhou 2020-01-21 MT253710 China: Hangzhou 2020-01-21 MT256917 Spain: Valencia 2020-03-02 , gapped MT256918 Spain: Valencia 2020-03-06, gapped MT256924 Colombia: Antioquia 2020-03-11, gapped MT258377 USA: CA 2020-01-18 MT258378 USA: CA 2020-01-18 MT258379 USA: CA 2020-01-18 MT258380 USA: CA 2020-01-18 MT258381 USA: CA 2020-01-18 MT258382 USA: CA 2020-01-18 MT258383 USA: CA 2020-01-18 MT259226 China: Hubei, Wuhan 2020-01-10 MT259227 China: Hubei, Wuhan 2020-01-26 MT259228 China: Hubei, Wuhan 2020-01-26 MT259229 China: Hubei, Wuhan 2020-01-26 MT259230 China: Hubei, Wuhan 2020-01-25 MT259231 China: Hubei, Wuhan 2020-01-25 MT259235 USA: WA 2020-03-13 MT259236 USA: WA 2020-03-16 MT259237 USA: WA 2020-03-16 MT259238 USA: WA 2020-03-16 MT259239 USA: WA 2020-03-16 MT259240 USA: WA 2020-03-16 MT259241 USA: WA 2020-03-16 后续数据太多了，直接到这里看： SARS-CoV-2 (Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2) Sequences 数据下载到这里：Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 data hub |
新型冠状病毒肺炎（Corona Virus Disease 2019，COVID-19），简称“新冠肺炎”，是指2019新型冠状病毒感染导致的肺炎。2019年12月以来，湖北省武汉市部分医院陆续发现了多例有华南海鲜市场暴露史的不明原因肺炎病例，现已证实为2019新型冠状病毒感染引起的急性呼吸道传染病。国际病毒分类委员会声明，将新型冠状病毒命名为“SARS-CoV-2”（Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2）；并认定这种病毒是SARS冠状病毒的姊妹病毒。
