彭司实验室

==============
MERS病毒基因组
==============

========
基因组汇总
========

=======
数据汇总
=======

.Middle East respiratory syndrome coronavirus

(Ref. Seq., Fouchier,R.A., 13-Jun-2012)

======================================

2012

1.Riyadh_1_2012

2.Riyadh_2_2012,

4.Middle East respiratory syndrome coronavirus (2012)

======================================

2013

1.Al-Hasa_12_2013

2.Al-Hasa_15_2013

3.Al-Hasa_16_2013

4.Al-Hasa_17_2013,

5.Al-Hasa_18_2013

6.Al-Hasa_19_2013

7.Al-Hasa_21_2013

8.Buraidah_1_2013

9.Hafr-Al-Batin_1_2013

10.Riyadh_3_2013,

11.Riyadh_4_2013

12.Riyadh_5_2013

13.Riyadh_9_2013

14.Riyadh_14_2013

16.Hafr-Al-Batin_2_2013

17.Hafr-Al-Batin_6_2013

18.Wadi-Ad-Dawasir_1_2013

19.Hu/Oman_2874_2013,

20.Hu/Oman_2285_2013

21.Hu/UAE_002_2013

22.Hu/UAE_004_2013

23.Hu/UAE_011_2013

24.Hu-France - FRA2_130569-2013_Isolate_Sanger

25.Hu-France - FRA2_130569-2013_InSpu_Sanger

26.Hu-France - FRA2_130569-2013_IS_HTS

27.Hu-France (UAE) - FRA1_1627-2013_BAL_Sanger

28.Jeddah_1_2013,

29. Abu Dhabi_UAE_9_2013

30.Al-Hasa_1_2013

31.Al-Hasa_2_2013

32.Al-Hasa_3_2013

33.Al-Hasa_4_2013

34.Al-Hasa_25_2013

35.England/3/2013,

36.England/4/2013

37.England/2/2013

38.NL13892 (2013)

39. Middle East respiratory syndrome coronavirus (2013)

40.Qatar3 (2013)

41.Qatar4(2013)

42.FRA/UAE (2013)

43.NL13845 (2013)

==================================

2014

7.Abu Dhabi_UAE_8_2014

5.Abu Dhabi_UAE_16_2014

6.Abu Dhabi_UAE_18_2014

1. Abu Dhabi_UAE_26_2014

4. Abu Dhabi_UAE_30_2014

2. Abu Dhabi_UAE_33_2014

3. Abu Dhabi/Gayathi_UAE_2_2014,

8.Hu/UAE_X_2014

16.Hu/UAE_009_2014

14.Hu/UAE_011_2014

13.Hu/UAE_015_2014

12.Hu/UAE_017_2014,

11.Hu/UAE_023_2014

10.Hu/UAE_025_2014

9.Hu/UAE_032_2014

17.Hu/Jordan-201440011858/2014,

18.Hu/Jordan-201440011123/2014,

19.Riyadh_2014KSA_683/KSA/2014,

20.Makkah_C9355/KSA/Makkah/2014-04-15,

21.Jeddah_C10306/KSA/2014-04-20,

22.Jeddah_C9055/KSA/2014-04-14,

23.Jeddah_C8826/KSA/2014-04-12,

24.Jeddah_C7770/KSA/2014-04-07,

25.Jeddah_C7569/KSA/2014-04-03,

26.Jeddah_C7149/KSA/2014-04-05,

27.Indiana/USA-1_Saudi Arabia_2014,

28.Florida/USA-2_Saudi Arabia_2014)

29.NL140455 (2014)

30.Hu/Taif/KSA-7032/2014

31.Hu/Jordan-201440011123/2014,

32.Hu/Jordan-20140010168/2014

33.Hu/Taif/KSA-7032/2014/S530del,

35.KFMC-1, (2014)

38.KFMC-2 (2014)

44.KFMC-3 (2014)

42.KFMC-4 (2014)

45.KFMC-5 (2014)

39.KFMC-6 (2014)

34.KFMC-7, (2014)

36.KFMC-8 (2014)

43.KFMC-9 (2014)

37.KFMC-10 (2014)

40.NL140422 (2014)

========================================

2015

1.Hu/Riyadh-KSA-023D3N/2015,

2.Hu/Riyadh-KSA-023D1N/2015,

3.Hu/Hufuf-KSA-11401/2015

4.Hu/Hufuf-KSA-11150/2015,

5.Hu/Hufuf-KSA-11767/2015,

6.Hu/Hufuf-KSA-11442/2015,

7.Hu/Hufuf-KSA-11002/2015,

8.Hu/Aseer-KSA-Rs924/2015,

9.Hu/Khobar-KSA-6736/2015,

10.Hu/Oman_50_2015

11. MERS-CoV/THA/CU/17_06_2015 （17-Jun-2015）

12.MERS-CoV/KOR/Seoul/177-3-2015 (South Korea, 03-Jul-2015)

13.MERS-CoV/KOR/Seoul/169-2015 (South Korea, 26-Jun-2015)

14.ChinaGD01 (China, 27-May-2015)

15.Hu/Riyadh-KSA-031D1N/2015,

16.Hu/Riyadh-KSA-015D1P/2015,

17.Hu/Riyadh-KSA-014D1N/2015,

18.Hu/Riyadh-KSA-012D1S/2015,

19.Hu/Riyadh-KSA-009D1N/2015,

20.Hu/Riyadh-KSA-007D1N/2015,

21.Hu/Riyadh-KSA-006D1S/2015,

22.Hu/Riyadh-KSA-005D1S/2015,

23.Hu/Riyadh-KSA-004D1S/2015,

24.Hu/Riyadh-KSA-002D1N/2015,

25.Korea/Seoul/SNU1-035/2015

26.Hu/Riyadh_KSA_4050_2015

27.Hu/Riyadh_KSA_2959_2015

28.Hu/Riyadh_KSA_4050_2015

29.Hu/Riyadh_KSA_2959_2015

30.KOREA/Seoul/168-2-2015

31.KOREA/Seoul/168-1-2015,

32.KOREA/Seoul/035-2-2015,

33.KOREA/Seoul/035-1-2015,

34.KOREA/Seoul/014-2-2015,

35.KOREA/Seoul/014-1-2015,

36KOREA/Seoul/163-1-2015

37.KOREA/Seoul/163-2-2015,

38.Hu/Amman-Jordan-12716/2015,

39.Hu/Amman-Jordan-12918/2015

40.Hu/Amman-Jordan-13030/2015,

41.Hu/Amman-Jordan-12641/2015,

42.KNIH/002_05_2015

43.Hu/Riyadh-KSA-008D3N/2015,

44.MERS-CoV/KOR/KNIH/002_05_2015

45. MERS-CoV/KOR/Seoul/162-1-2015

46. MERS-CoV/KOR/Seoul/080-3-2015,

47. MERS-CoV/KOR/Seoul/077-2-2015,

48.MERS-CoV/KOR/Seoul/066-2015,

49.Hu/Riyadh-KSA-16098/2015

50.Hu/Riyadh-KSA-16077/2015

51.Hu/Riyadh-KSA-16117/2015

52.Hu/Riyadh-KSA-16120/2015

53.Hu/Riyadh-KSA-16121/2015

54.Hu/Jeddah-KSA-3RS2702/2015,

55.Hu/Jeddah-KSA-C20860/2015

56.Hu/Najran-KSA-C20915/2015,

57.Hu/Kharj-KSA-2598/2015

58.Hu/Kharj-KSA-2599/2015

59.Hu/Riyadh-KSA-2716/2015,

60.Hu/Riyadh-KSA-3181/2015

61.Hu/Khobar-KSA-6736/2015

62.Hu/Hufuf-KSA-9158/2015

63.Hu/Hufuf-KSA-11002/2015

64.Hu/Jeddah-KSA-C21271/2015

65.Hu/Jeddah-KSA-C20843/2015

66.Hu/Riyadh-KSA-2049/2015

67.Hu/Riyadh-KSA-2466/2015

68.Hu/Riyadh-KSA-2343/2015

69.Hu/Riyadh-KSA-2345/2015

70.MERS-CoV/KOR/KNIH/001_05_2015,

71.HCoV-EMC (2015)

72.Qatar15 (2015)

========================================

2016

1.Hu/Riyadh-KSA-13798/2016 (Saudi Arabia, 05-Mar-2016)

2.Hu/Qasim-KSA-13922/2016 (Saudi Arabia, 06-Mar-2016)

3.Hu/Riyadh-KSA-14607/2016 ( Saudi Arabia, 12-Mar-2016)

4.Hu/Riyadh-KSA-14675/2016 (Saudi Arabia, 13-Mar-2016)

5.Hu/Riyadh-KSA-16559/2016

6.Hu/Riyadh-KSA-24241/2016,

7.Hu/Riyadh-KSA-24244/2016,

8.Hu/Riyadh-KSA-21155/2016,

9.Hu/Riyadh-KSA-20570/2016,

10.Hu/Riyadh-KSA-19949/2016,

11.Hu/Qasim-KSA-893/2016,

12.Hu/Madinah-KSA-390/2016,

13.Hu/Riyadh-KSA-15385/2016,

14.Hu/Riyadh-KSA-13984/2016,

15.Hu/Riyadh-KSA-K37029157/2016

16.Hu/Riyadh-KSA-21891/2016,

17.Hu/Riyadh-KSA-16849/2016,

18.Hu/Riyadh-KSA-17382/2016,

19.Hu/Riyadh-KSA-17756/2016,

20.Hu/Riyadh-KSA-14670/2016,

21.Hu/Riyadh-KSA-14949/2016,

22.Hu/Riyadh-KSA-14675/2016,

23.Hu/Riyadh-KSA-14607/2016,

24.Hu/Qasim-KSA-13922/2016,

25.Hu/Riyadh-KSA-13798/2016,

26.Hu/Riyadh-KSA-036D1N/2016,

27.Hu/Riyadh-KSA-039D3T/2016,

28.Hu/Artawiyah-KSA-13328/2016

29.Hu/Riyadh-KSA-13127/2016

30.Hu/Riyadh-KSA-12969/2016

31.Hu/Riyadh-KSA-12832/2016

31.Hu/Jeddah-KSA-161RS1146/2016,

33.Hu/Riyadh-KSA-10208/2016

34.Hu/Riyadh-KSA-12160/2016

35.Hu/Riyadh-KSA-11958/2016

36.Hu/Riyadh-KSA-11898/2016

37.Hu/Riyadh-KSA-11740/2016

38.Hu/Riyadh-KSA-11739/2016

39.HCoV-EMC (2016)

40.isolate 2362 (2016)

41.isolate 2363 (2016)

========================================

2017

1.Hu/Jeddah-KSA-173RS1101/2017

2.Hu/Riyadh-KSA-K17000405/2017,

3.Hu/Riyadh-KSA-K17000887/2017,

4.Hu/Riyadh-KSA-9730/2017,

5.Hu/Riyadh-KSA-9522/2017,

6.Hu/Riyadh-KSA-9852/2017,

7.Hu/Riyadh-KSA-9835/2017,

8.Hu/Riyadh-KSA-9689/2017,

9.Hu/Riyadh-KSA-9693/2017,

10.Hu/Riyadh-KSA-9614/2017,

11.Hu/Riyadh-KSA-10308/2017,

12.Hu/Riyadh-KSA-8882/2017,

13.Hu/Riyadh-KSA-8667/2017,

14.Hu/Riyadh-KSA-7680/2017

15.Hu/Riyadh-KSA-7423/2017,

16.Hu/Riyadh-KSA-7373/2017,

17.Hu/Riyadh-KSA-7178/2017,

18.Hu/Riyadh-KSA-7413/2017,

19.Hu/Jeddah-KSA-173RS1570/2017,

20.Hu/Jeddah-KSA-173RS1512/2017

21.Hu/Aseer-KSA-173RS1288/2017,

22.Hu/Riyadh-KSA-7344/2017,

23.Hu/Riyadh-KSA-10717/2017,

24.Hu/Riyadh-KSA-7696/2017,

25.Hu/Riyadh-KSA-5767/2017,

26.Hu/Riyadh-KSA-10024/2017,

27.Hu/Riyadh-KSA-8683/2017,

28.Hu/Riyadh-KSA-8677/2017,

29.Hu/Riyadh-KSA-7436/2017,

30.isolate 2366 (2017)

========================================

2018

1.Hu/Albaha-KSA-0800H/2018,

2.Hu/Riyadh-KSA-18014506/2018,

3.Hu/Riyadh-KSA-18014504/2018,

4.Hu/Qaseem-KSA-18013897/2018,

5.Hu/Tabuk-KSA-153/2018

6.Hu/Northern-KSA-1847784/2018,

7.Hu/Najran-KSA-183RS279/2018,

8.Hu/Riyadh-KSA-18012493/2018,

9.Hu/Najran-KSA-182RS2567/2018

10.Hu/Jeddah-KSA-182RS2449/2018,

12.MERS-CoV/KOR/KCDC/001_2018-TSVi,

12.Hu/Riyadh-KSA-18013832/2018,

13.MERS-CoV_England-KSA/1/2018(sputum),

========================================

2019

1.Hu/Riyadh-KSA-19003852/2019,

2.Hu/Riyadh-KSA-19001796/2019,

3.llama-passaged-Qatar15, (2019)

4.coronavirus isolate 016 (2019)

========================================

2020

========================================

什么是MERS病毒？

MERS（Middle East Respiratory Syndrome）病毒是一种新型的冠状病毒，这种病毒已经被命名为中东呼吸综合症冠状病毒，大多数MERS病毒感染病例发生在沙特。 MERS-CoV最早于2012年9月在沙特被发现，早期因与SARS临床症状相似得名"类SARS病毒"，也成为第6种已知的人类冠状病毒，也是过去10年内被分离出来的第3种。人体内的冠状病毒最早于1960年代在英国被分离出来，病毒因其表面皇冠状的突起物而得名。它可能与人、猪、猫、狗、鼠和鸡的呼吸系统感染相关。出于通俗易懂的考虑，媒体经常把MERS称为新SARS，但事实上，虽然这两种病毒同属于冠状病毒，但它们在基因上具有明确的差异，而且感染人体时使用不同的受体。