彭司实验室

本组最近成果摘要

========= 科研信息 =========

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徐煊宇发现SARS-CoV-2的S蛋白氨基酸序列存在明显的正选择。

SARS-CoV-2 S蛋白的分子进化与变异特征

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摘要：SARS-CoV-2 是2019年底新发现的一种新型β-冠状病毒，具有高致病性，对人类健康构成严重威胁。在本文中，通过对该新病毒进行生物信息学分析，研究其S蛋白的分子进化和变异。使用从美国采样得213条SARS-CoV-2 样本，通过MCMC法分析其全基因组序列和S蛋白序列的进化速率，发现全基因组的进化速率高于S蛋白区域，且所得结果与之前研究相比，进化速率均较低。由于其与GenBank中多种蝙蝠SARS-like冠状病毒、SARS-CoV的序列高度相似，通过建立他们的系统发育树来研究SARS-CoV-2 S蛋白的选择性进化。根据研究结果，SARS-CoV-2的S蛋白存在明显的正选择，发现了12个具有统计学意义的阳性选择位点，其中3个位于S蛋白的受体结合域。此外，序列比对结果显示，213条SARS-CoV-2样本中已经出现多个非同义突变位点，根据序列同源性和氨基酸物理性质预测，存在会造成S蛋白结构和功能的突变。

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