首页
English
关于我们
研究方向
科研信息
教学信息
论文发表
病毒学
宏基因组
药物设计
人工智能
彭司实验室
本组最近成果摘要
=========
科研信息
=========
==================================================================
2022年11月17日,卫偲青藏高原宏基因组学论文在Enviromental Research发表
==================================================================
基于宏基因组学的巴木措微生物群落结构和代谢能力研究
青藏高原微生物在全球生物地球化学循环中起着至关重要的生态作用。但是,目前仍然缺乏有关青藏高原中微生物群落的详细信息。
我们通过宏基因组学方法重建了75个几乎完整的细菌基因组草图(MAGs),发现变形杆菌,放线菌和厚壁菌是巴木措三个最主要的细菌门,而广古菌是最主要的古菌门。
令人惊讶的是,我们在巴木措湖的近岸土壤中发现了潘多拉病毒(
Pandoravirus salinus
)。潘多拉病毒与已知病毒截然不同,它有2,500多个基因,而一般的病毒只有10个左右基因,例如新冠病毒有10个基因,艾滋病有9个基因。所以有人建议把潘多拉这样的巨病毒分类为除了细菌、古菌与真核生物这三界以外的第四界生物。该病毒是 2013 年法国科学家Philippe 等分别于智利中海岸河流沉积物表层和澳大利亚墨尔本附近一个淡水池塘底部泥浆中首次发现。据信该病毒是地球上有史以来最大的病毒,一般认为它生活在水中,而这次我们却在土壤中发现了该病毒。
我们的结论认为巴木措的微生物主要通过3-羟基丙酸双环途径(3-hydroxypropionic bi-cycle pathway)固定碳。本研究首次揭示了青藏高原高海拔地区(海拔4,555米)的微生物群落组成和代谢能力,证实了青藏高原是一个巨大而且有开发价值的资源库,在其中有望开发出新型非耐药性抗生素和其他生物活性物质。
2022.11.25 全文下载:
pdf
, or
pdf
我们的特色
我们用计算手段解码生命