彭司实验室

本组最近成果摘要

========= 科研信息 =========

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王世航等在Journal of Medical Virology期刊发表新冠病毒分子进化特征研究论文
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美国出现的SARS-CoV-2病毒的分子进化特征研究

SARS-CoV-2是2019年底新发现的一种β冠状病毒，具有高致病性，对人类健康构成严重威胁。本文利用从美国取样的1875条SARS-CoV-2全基因组序列和69098个氨基酸序列的刺突蛋白（S蛋白）进行生物信息学分析，研究其基因组和刺突蛋白的分子进化特征。 MCMC方法用于计算全基因组序列的进化率和编码刺突蛋白（S基因）的序列的核苷酸突变率。结果表明，全基因组核苷酸突变率为6.677×10-4置换/位点/年，S基因核苷酸突变率为8.066×10-4/位点/年置换，处于中等水平。与其他 RNA 病毒相比。我们的研究结果证实了科学假设，即病毒的进化速度会随着时间的推移逐渐降低。我们还在 SARS-CoV-2 基因组中发现了 13 个具有统计学意义的阳性选择位点。此外，S蛋白序列比对结果显示，所有样本中共有101个非同义突变位点，其中包括7个推定的有害突变位点。该论文初步阐明了美国SARS-CoV-2的进化特征，为今后监测和预防病毒变种提供科学依据。

作者简介：王世航为本校水产与生命学院水产养殖专业2018级本科生，现已被本校推免为上海科技大学2022级硕士生。

原文链接：

Molecular evolutionary characteristics of SARS-CoV-2 emerging in the United States： DOI： 10.1002/jmv.27331

2021.9.10

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