GISAID data download (01-April-2020)
SARS-cov-2-3327-genome-aligned
(2732 cases in GISAID,up to 01-April-2020,
505 cases NCBI, 11-April-2020) excel
1. SARS-cov-2： MN908947(Dec-2019）Fudan
2. MN996529 Wuhan （23-Dec-2019）
3. MT019529 Wuhan （23-Dec-2019）
4. MT019530 Wuhan （30-Dec-2019）
5. MT019531 Wuhan （30-Dec-2019）
6. MT019532 Wuhan （30-Dec-2019）
7. MT019533 Wuhan （30-Dec-2019）
8. MN996527 Wuhan （30-Dec-2019）
9. MN996528 Wuhan WIV04 （30-Dec-2019） Zhengli Shi
10. MN996530 Wuhan （30-Dec-2019）
11. MN996531 Wuhan （30-Dec-2019）
==================================
12. LC529905 Japan Jan-2020
13. MT039890 Korea （Jan-2020）
14. MN988668 China （02-Jan-2020）
15. MN988669 China （02-Jan-2020）
16. MT093631 China （08-Jan-2020）
17. MN938384 Shenzhen （10-Jan-2020）
18. MN975262 China （11-Jan-2020）
19. MT072688 Nepal （13-Jan-2020）
20. MT049951 Yunan （17-Jan-2020）
21. MN985325 USA （19-Jan-2020）
22. MT226610 China （20-Jan-2020）
23. MT039873 Hangzhou （20-Jan-2020）
24. MN988713 USA IL （21-Jan-2020）
25. MN997409 USA （22-Jan-2020）
26. MT192772 Viet Nam: Ho Chi Minh city （2020-01-22）
27. MT192773 Viet Nam: Ho Chi Minh city （2020-01-22）
28. MN994467 USA （23-Jan-2020）
29. MN994468 USA CA （23-Jan-2020）
30. MT020881 USA WA （25-Jan-2020）
31. MT007544 Australia （25-Jan-2020）
32.MT192759 Taiwan（25-Jan-2020）
33. MT135041 Beijing （26-Jan-2020）
34. MT044258 USA CA （27-Jan-2020）
35. MT123292 Guangzhou （27-Jan-2020）
36. MT012098 India （27-Jan-2020）
37. MT135042 Beijing （28-Jan-2020）
38. MT135043 Beijing （28-Jan-2020）
39. MT135044 Beijing （28-Jan-2020）
40. MT044257 USA IL （28-Jan-2020）
41. MT020781 芬兰 （29-Jan-2020） partial
42. MT020880 USA WA （29-Jan-2020）
43. MT027062 USA CA （29-Jan-2020）
44. MT027063 USA CA （29-Jan-2020）
45. MT027064 USA CA （29-Jan-2020）
46·. MT123293 Guangzhou （29-Jan-2020）
47. MT123291 Guangzhou （29-Jan-2020）
48. LR757995 Wuhan (30-JAN-2020 sub)
49. LR757996 Wuhan (30-JAN-2020 sub)
50.LR757997 Wuhan （30-Jan-2020）Partial
51. LR757998 Wuhan (30-JAN-2020 sub)
52. MT066156 italy （30-Jan-2020）
53. MT039887 USA WI （31-Jan-2020）
54. MT039888 USA（31-Jan-2020）
55. MT066175 Taiwan （31-Jan-2020）
56. MT066176 Taiwan （31-Jan-2020）
57. MT050493 India （31-Jan-2020）
==================================
58. MT106052 USACA （06-Feb-2020）
59. MT093571 Sweden（07-Feb-2020）
60. LC528232 (Japan，2020-02-10）
61. LC528233 (Japan，2020-02-10）
62. MT106053 USACA （10-Feb-2020）
63 MT106054 USATX （11-Feb-2020）
64. MT118835 USA （23-Feb-2020）
65. MT152824 USA （24-Feb-2020）
66. MT126808 （Brazia，28-Feb-2020）
all-genome
67. MT159705 USA （17-Feb-2020）
68. MT159706 USA（17-Feb-2020）
69. MT159707 USA（17-Feb-2020）
70. MT159708 USA（17-Feb-2020）
71. MT159709 USA（20-Feb-2020）
72. MT159710 USA（17-Feb-2020）
73. MT159711 USA（20-Feb-2020）
74. MT159712 USA（25-Feb-2020）
75. MT159713 USA（18-Feb-2020）
76. MT159714 USA（18-Feb-2020）
77.MT159715 USA（24-Feb-2020）
78.MT159716USA（24-Feb-2020） Large fragments are missing
79.MT159717USA（17-Feb-2020）
80.MT159718USA（18-Feb-2020）
81.MT159719USA（18-Feb-2020）
82.MT159720USA（21-Feb-2020）
83.MT159721USA（21-Feb-2020）
84.MT159722USA（21-Feb-2020）
85.MT163716 USA（27-Feb-2020)
86.MT163717 USA（28-Feb-2020)
87.MT163718 USA（29-Feb-2020)
88. MT184907 USA 18-Feb-2020
89.MT184908 USA 21-Feb-2020
90.MT184909 USA 21-Feb-2020
91.MT184910 USA 18-Feb-2020
92.MT184911 USA 17-Feb-2020
93.MT184912 USA 17-Feb-2020
94.MT184913 USA 24-Feb-2020
95.MT163719 USA（01-Mar-2020)
96.MT163720 USA（01-Mar-2020) near complete
97.MT163721USA（01-Mar-2020) near complete
98.MT198651 Spain: Valencia （04-Feb-2020）near complete
99.MT198652 Spain: Valencia （05-Feb-2020）near complete |
100. MT123290 ChinaGuangzhou （05-Feb-2020）
101. MT198653 Spain: Valencia （08-Feb-2020）near complete
LC534418 Japan 2020-02-14
102..MT188339 USA（09-Mar-2020）
103. MT188340 USA（07-Mar-2020）
104. MT188341 USA（05-Mar-2020）
105. MT192765 USA: CA （2020-03-11）
106. MT233519 Spain: Valencia 2020-02-27
107. MT233520 Spain: Valencia 2020-02-26, gapped
108. MT233521 Spain: Valencia2020-02-27, gapped
109. MT233522 Spain: Valencia2020-03-02
110. MT233523 Spain: Valencia 2020-03-04
111.MT240479 Pakistan: Gilgit 2020-03-04
LC534419 Japan 2020-03-09
112.MT246449 USA: WA 2020-03-13
113. MT246450 USA: WA 2020-03-13
114.MT246451 USA: WA 2020-03-13
115. MT246452 USA: WA 2020-03-13
116. MT246453 USA: WA 2020-03-13
117.MT246454 USA: WA 2020-03-12
118.MT246455 USA: WA 2020-03-12
119. MT246456 USA: WA 2020-03-13
120 MT246457 USA: WA 2020-03-12
121. MT246458 USA: WA 2020-03-12
122.MT246459 USA: WA 2020-03-12
123.MT246460 USA: WA 2020-03-12
124. MT246461 USA: WA 2020-03-13
125.MT246462 USA: WA 2020-03-13
126.MT246463 USA: WA2020-03-13, gapped
127.MT246464 USA: WA2020-03-13
128. MT246465 USA: WA 2020-03-13, gapped
129.MT246466 USA: WA 2020-03-13
130.MT246467 USA: WA 2020-03-14
131.MT246468 USA: WA 2020-03-14
132 MT246469 USA: WA 2020-03-14
133 MT246470USA: WA 2020-03-13
134 MT246471 USA: WA 2020-03-14
135 MT246472 USA: WA 2020-03-12
136 MT246473 USA: WA 2020-03-14
137 MT246474 USA: WA 2020-03-14
138 MT246475 USA: WA 2020-03-13
139 MT246476 USA: WA 2020-03-13
140 MT246477 USA: WA 2020-03-14
141 MT246478 USA: WA 2020-03-14
142 MT246479 USA: WA 2020-03-13
143 MT246480 USA: WA 2020-03-13
144 MT246481 USA: WA 2020-03-13
145 MT246482 USA: WA 2020-03-15
146 MT246483 USA: WA 2020-03-15, gapped
147 MT246484 USA: WA 2020-03-15
148 MT246485 USA: WA 2020-03-15
149 MT246486 USA: WA 2020-03-14
150 MT246487USA: WA 2020-03-15
151 MT246488 USA: WA 2020-03-14
152 MT246489 USA: WA 2020-03-14
153 MT246490 USA: WA 2020-03-15
MT251972 USA: WA 2020-03-14
MT251973 USA: WA 2020-03-14
MT251974 USA: WA 2020-03-12
MT251975 USA: WA 2020-03-14
MT251976 USA: WA 2020-03-14
MT251977 USA: WA 2020-03-14
MT251978 USA: WA 2020-03-14
MT251979 USA: WA 2020-03-14
MT251980 USA: WA 2020-03-13
MT253696 China: Hangzhou 2020-01-23
MT253697 China: Hangzhou 2020-01-23
MT253698 China: Hangzhou 2020-01-23
MT253699 China: Hangzhou 2020-01-24
MT253700 China: Hangzhou 2020-01-25
MT253701 China: Hangzhou 2020-01-21
MT253702 China: Hangzhou 2020-01-21
MT253703 China: Hangzhou 2020-01-25
MT253704 China: Hangzhou 2020-01-25
MT253705 China: Hangzhou 2020-01-22
MT253706 China: Hangzhou 2020-01-22
MT253707 China: Hangzhou 2020-01-25
MT253708 China: Hangzhou 2020-01-21
MT253709 China: Hangzhou 2020-01-21
MT253710 China: Hangzhou 2020-01-21
MT256917 Spain: Valencia 2020-03-02 , gapped
MT256918 Spain: Valencia 2020-03-06, gapped
MT256924 Colombia: Antioquia 2020-03-11, gapped
MT258377 USA: CA 2020-01-18
MT258378 USA: CA 2020-01-18
MT258379 USA: CA 2020-01-18
MT258380 USA: CA 2020-01-18
MT258381 USA: CA 2020-01-18
MT258382 USA: CA 2020-01-18
MT258383 USA: CA 2020-01-18
MT259226 China: Hubei, Wuhan 2020-01-10
MT259227 China: Hubei, Wuhan 2020-01-26
MT259228 China: Hubei, Wuhan 2020-01-26
MT259229 China: Hubei, Wuhan 2020-01-26
MT259230 China: Hubei, Wuhan 2020-01-25
MT259231 China: Hubei, Wuhan 2020-01-25
MT259235 USA: WA 2020-03-13
MT259236 USA: WA 2020-03-16
MT259237 USA: WA 2020-03-16
MT259238 USA: WA 2020-03-16
MT259239 USA: WA 2020-03-16
MT259240 USA: WA 2020-03-16
MT259241 USA: WA 2020-03-16
There are too many follow-up data, just look here:
SARS-CoV-2 (Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2) Sequences
Download the data here：Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 data hub |