本组最近成果摘要 |
========= 科研信息 ========= |
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2023年3月1日，王世航，沈哲涵在Molecules上发表研究论文
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信使 RNA (mRNA) 的亚细胞定位精确控制蛋白质产物的合成位置和功能。 然而，通过湿实验室实验获得 mRNA 的亚细胞定位既费时又昂贵，许多现有的 mRNA 亚细胞定位预测算法需要改进。 在这项研究中，提出了一种基于深度神经网络的真核 mRNA 亚细胞定位预测方法 deepmRNALoc，利用两阶段特征提取策略，第一阶段采用双峰信息分裂和融合，第二阶段采用 VGGNet 类 CNN 模块 第二阶段。 这 DeepmRNALoc 在细胞质、内质网、细胞外区域、线粒体和细胞核中的五倍交叉验证准确度分别为 0.895、0.594、0.308、0.944 和 0.865，表明它优于现有模型和技术。
论文全文链接： https://www.mdpi.com/1420-3049/28/5/2284
本文源代码和数据：GitHub - Thales-research-institute/DeepmRNALoc
模型部署服务器：http://www.peng-lab.org:8080/mRNA/